פיקוד העורף (פקע"ר), הוקם בפברואר 1992, בעקבות הפגזות הטילים במלחמת המפרץ (1991) , שהייתה בעצם המלחמה הראשונה (לאחר מלחמת העצמאות) שבה היה איום עיקרי על העורף. ליפני כן היה הטיפול בעורף באחריות מפקדת קצין חייל ראשי - מקחל"ר להג"א (התגוננות אזרחית) והגמ"ר (הגנה מרחבית). בסיום מלחמת המפרץ הראשונה אוחדו ארגונים אלו והוקם פיקוד העורף.
מאז הקמת פיקוד העורף נעשו מאמצים רבים להפכו לגוף אזרחי אולם הם לא צלחו עד היום.
